目前國內中央空調水系統的水質處理主要采用一下3種方法：
（1） 利用鈉離子交換器補充軟化水，控制中央空調循環水系統水質。
（2） 在中央空調循環水系統上設置電子水處理器，用于循環水系統的防垢、除垢、殺菌和滅藻。
（3） 在中央空調循環水系統中添加化學藥劑（清洗劑、預膜劑、阻垢緩蝕劑、殺生劑等）來控制結垢、腐蝕和微生物繁殖，達到水質處理的目的。
方法（1）：需增加鈉離子交換器、鹽罐等設備，初投資較高。鈉離子交換器有正洗、反洗、還原和交換步驟，運行管理較麻煩，軟化水質化驗須由專人負責，可行性較差。
方法（2）：因為電子水處理器適用水質范圍為總硬度不大于550mg/1（以碳酸鈣），或因空調系統間斷運行，或因電器出現故障，其處理效果不佳。
方法（3）：可除去多數物理清洗不易除去的硬垢和腐蝕產物，清洗時可不打開設備，對設備內間隙小的部位也能進行清洗。但該方法清洗時若處理不當或緩蝕劑使用不當，會引起設備的嚴重腐蝕，須加以重視。化學處理方法主要包括化學清洗、鈍化預膜和阻垢緩蝕3部分。