一、水
1、給水
生物制藥車間的給水包括工藝用水、循環冷卻用水、洗滌用水、鍋爐用水等生產用水及生活用水和消防用水。
工藝用水直接影響到半成品和成品的質量，通常不同產品或不同工序對水質的要求不同；生物制藥廠生產時，常用水來帶走反應產生的熱量或使物料溫度下降，水經過一次使用后溫度上升，為了降低用水量，將升溫后的水送至冷卻塔與空氣換熱從而冷卻，此冷卻水可以循環使用，稱為循環冷卻水，循環水的供水壓力一般為0.34～0.5MPa；洗滌用水主要用于清洗設備、器具和地面等，水質應滿足清洗要求；鍋爐用水要求是軟化水；生活用水包括清洗用水、飲食用水，一般按自來水的質量標準；消防用水系統一般是獨立設置的，包括消防水池、消防水系統和消防水管道，消防水系統的壓力一般為0.5～1.0MPa。
為滿足給水的需要，必須有輸配水系統。輸配水系統一般包括清水泵房、調節水箱、廠區給水管網和室內管道。管網上的水壓比每個車間或建筑物最高層用水要求的水壓高0.1～0.15MPa。一個車間的進水管至少分兩路接入，故廠區應采用環狀管網，以確保供水正常。
2、排水
制藥企業的排水系統按照“清污分流、分別排放"的原則，根據排放水的性質不同分為生產污水系統、生活污水系統和清潔廢水系統。
生物制藥廠的排出水包括生產污水、生產廢水、生活污水和雨水四種。生產污水中往往含有微生物和一些有害物質，尤其是發酵車間和提取車間，這些生產污水必須經過處理達到排放標準后才能排放；生活污水中含有易腐化的有機物和各種致病菌，在排除前也必須經過處理；生產廢水和雨水屬于清潔廢水，一般可以不經過處理直接排入水體。
二、電
生物制藥廠主要由地區電網供電，其供電系統一般由變壓設備、配電線路和設備、用電設備等構成。車間用電包括動力用電和照明用電。
在供電設計中，必須提供各個車間的用電設備的安裝容量，作為設計基礎，然后把安裝負荷轉化為計算負荷，根據全廠的計算負荷選擇供電線路和供電設備。一般生物制藥廠尤其是大型廠，由于廠區范圍大，全廠用電設備的容量也大，須根據供電部門的供電情況，設置變壓器，各車間有配電室用于接受和分配電能，但配電室不能進行電壓變換。
生物制藥廠的照明分為一般照明、局部照明、混合照明。燈具以熒光燈為主，部分不宜采用熒光燈的區域采用白熾燈。潔凈區內應全部采用凈化燈具；走廊、人員流動通道、主要生產崗位及緊急疏散通道應設置帶應急電源的應急燈；通道入口、緊急出口、樓梯口及其它必要的地方應設置帶應急電源的燈具；高架倉庫常選用高壓鈉燈；爆炸危險場所應選用防爆燈具；潮濕的生產場所應選用防潮燈。
三、蒸氣
生產制藥廠的生產、  空氣調節與采暖及生活上的所需的蒸氣或熱水，可以由熱電廠供給，也可以由自設鍋爐房提供。
熱電廠輸送到生物制藥廠的蒸氣一般為1.6MPa左右的過熱蒸氣，須設置全廠總蒸氣分配站進行減壓，并在必要的時候向過熱蒸氣中噴人一定量的水，使之成為0.8MPa飽和蒸氣后再供工廠使用。自設鍋爐時，鍋爐的蒸氣參數應滿足工廠生產、空調與采暖的需要。
四、氣
生物制藥生產廠房空氣調節方式有兩種：舒適空調和凈化空調。前者主要是為了滿足人體的舒適感而配置的空氣調節系統，可根據《采暖通風與空氣調節設計規范》的要求確定室內溫度；后者是根據GMP的要求，控制對潔凈室內潔凈環境產生影響的室外物質，防止塵埃粒子和微生物對藥品生產造成污染而設置的，除生產工藝有特殊要求外，一般溫度為18℃～26℃，相對濕度為45%～65%。
凈化空調系統可分為三種形式：集中式、半集中式、分散式。集中式凈化空調系統把系統內單個或多個潔凈室所需的凈化空調設備都集中在機房內，用送風管道將潔凈空氣分配給各個潔凈室；半集中式凈化空調系統指在系統中既有集中的凈化空調機房，又有分散在各潔凈室內的空氣處理設備，是一種集中處理和局部處理相結合的形式；分散式凈化空調系統指在系統內各個潔凈室單獨設置凈化空調設備。
生物制藥生產潔凈廠房主要采用集中式凈化空調系統，其特點是：（1）在機房內對空氣集中處理，進而送進各個潔凈室；（2）集中處理后的潔凈空氣送入各潔凈室，以不同的換氣次數和氣流形式來實現各潔凈室內不同的潔凈度；（3）由于設備集中于機房，對噪聲和振動較容易處理。
集中式凈化空調系統基本流程見圖

室外的新鮮空氣經粗效過濾器過濾后與潔凈室回風混合，經空調機處理溫度、濕度，再經中效過濾器和高效過濾器過濾，進入各潔凈室內。當室內不產生有害物質時一般盡量利用回風以節省能源和投資。當室內不散發大量余熱時，可不再經過空調機而由循環風機直接和空調機處理過的空氣混合，進入中效過濾器。
系統中前兩級過濾器一般設在機房。粗效過濾器一般設在新風口處。中效過濾器一般設在循環風機之后，以保證中效過濾器以后風管內處于正壓狀態，防止管外灰塵從該段風管縫隙處侵入管內。高效過濾器一般設在潔凈室送風口處，以避免經過高效過濾器后的空氣再被管道污染。通過排風口可以排出潔凈室內的一部分空氣，以保證補入一定量的新鮮空氣。為了阻止凈化空調系統停止運行時室外空氣倒灌到潔凈室內，通常要求在排風口上設置止回閥、密閉閥、阻尼層及密封池。
潔凈室內的氣流組織可分為單向流和非單向流兩種。單向流按氣流方向分為垂直單向流和水平單向流；非單向流按其送風口位置分為頂送和側送，常見的送回風方式有：側送側回、頂送側回、頂送頂回。因為非單向流潔凈室具有投資省、運行費用低、改建擴建容易等優點，所以生物制藥廠大多應用非單向流送風。
五、風
生物制藥廠的通風方法可分為自然通風和機械通風。
自然通風利用建筑物的門、窗及縫隙進行自然換氣，或利用溫壓和風壓的作用而形成氣流交換，如墻下設通風口、屋面設氣窗。自然通風的風量無法控制，氣流也比較混亂。當自然通風達不到應有的要求時，可采用機械通風。在有大量蒸氣散發或易燃易爆、毒害氣體及粉塵散發的生產場所，必須進行機械通風或排風。機械通風可分為全面機械通風和局部機械通風。全面機械通風是指在廠房內全面進行空氣交換，有進風系統和排風系統兩部分。局部機械通風在有害物產生地點用專設的通風設備把它們收集起來，直接排除出去，或者將處理過，且合乎衛生要求的空氣送到工作場所。常用的局部機械通風措施有風扇和局部排風機。
六、暖
供暖系統通常有三個組成部分：熱發生器、供熱管道和散熱器。供暖系統可分為局部供暖系統和中樞暖氣系統。前者的特點是熱發生器、供熱管道和散熱器三個部分組成一體，如電加熱器；后者的特點是一個熱發生器向一個車間、一個建筑或全廠供應暖氣。根據熱介質性質，供暖系統又分為熱水、蒸氣和熱風采暖系統。
七、冷
生物制藥廠除了需要設置冷庫外，大部分冷量是用來制取低溫冷卻水或冷凍鹽水。通常冷凍系統分別用于空調、工藝設備或物料冷卻，故冷凍站的位置應當盡可能靠近其使用崗位。
制冷機主要有四大類：（1）壓縮式冷凍機，依靠壓縮機的作用來提高制冷劑的壓力以實現制冷循環；（2）蒸氣噴射制冷機，由蒸氣噴射器、蒸發器和冷凝器等設備組成，依靠蒸氣噴射器的抽吸作用在蒸發器中保持一定的真空，使水在其中蒸發而制冷；（3）吸收式制冷機，由消耗熱能來制冷，依靠吸收器-發生器組的作用完成制冷循環；（4）半導體值制冷機，利用半導體的熱-電效應制取冷量。